#bash

 for i in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 
do 
cd ref$i
cp  resa_1.pdb ../refinedPDB/resa_$i.pdb
cp resa_1.vio ../refinedPDB/resa_$i.vio
cd ..

done