data_3ana_residue save_MolProbity _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode MolProbity _Software.Entry_ID ? _Software.ID 1 _Software.Name MolProbity _Software.Version 4.0 _Software.Details . save_ save_CYRANGE _Software.Sf_category software _Software.Sf_framecode CYRANGE _Software.Entry_ID ? _Software.ID 2 _Software.Name CYRANGE _Software.Version 2.0 _Software.Details . save_ save_Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Sf_category structure_validation _Structure_validation_residue.Sf_framecode Structure_validation_residue _Structure_validation_residue.Entry_ID ? _Structure_validation_residue.List_ID 1 _Structure_validation_residue.PDB_accession_code 3ana _Structure_validation_residue.Date_analyzed 2016-10-12 loop_ _Residue_analysis_software.Software_ID _Residue_analysis_software.Software_label _Residue_analysis_software.Method_ID _Residue_analysis_software.Method_label _Residue_analysis_software.Entry_ID _Residue_analysis_software.Structure_validation_oneline_list_ID 1 MolProbity . . ? 1 2 CYRANGE . . ? 1 stop_ loop_ _Residue_analysis.ID _Residue_analysis.PDB_model_num _Residue_analysis.Hydrogen_positions _Residue_analysis.MolProbity_flips _Residue_analysis.Cyrange_core_flag _Residue_analysis.Two_letter_chain_ID _Residue_analysis.PDB_strand_ID _Residue_analysis.PDB_residue_no _Residue_analysis.PDB_ins_code _Residue_analysis.PDB_residue_name _Residue_analysis.Assembly_ID _Residue_analysis.Entity_assembly_ID _Residue_analysis.Entity_ID _Residue_analysis.Comp_ID _Residue_analysis.Comp_index_ID _Residue_analysis.Clash_value _Residue_analysis.Clash_source_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_atom_name _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_strand_ID _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_no _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_ins_code _Residue_analysis.Clash_destination_PDB_residue_name _Residue_analysis.Cbeta_deviation_value _Residue_analysis.Rotamer_score _Residue_analysis.Rotamer_name _Residue_analysis.Ramachandran_phi _Residue_analysis.Ramachandran_psi _Residue_analysis.Ramachandran_score _Residue_analysis.Ramachandran_evaluation _Residue_analysis.Ramachandran_type _Residue_analysis.Bond_outlier_count _Residue_analysis.Worst_bond _Residue_analysis.Worst_bond_value _Residue_analysis.Worst_bond_sigma _Residue_analysis.Angle_outlier_count _Residue_analysis.Worst_angle _Residue_analysis.Worst_angle_value _Residue_analysis.Worst_angle_sigma _Residue_analysis.RNA_phosphate_perpendicular_outlier _Residue_analysis.RNA_suitness_score _Residue_analysis.RNA_suite_conformer _Residue_analysis.RNA_suite_triage _Residue_analysis.Max_b_factor _Residue_analysis.Tau_angle _Residue_analysis.Omega_dihedral _Residue_analysis.Disulfide_chi1 _Residue_analysis.Disulfide_chi2 _Residue_analysis.Disulfide_chi3 _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle _Residue_analysis.Disulfide_ss _Residue_analysis.Disulfide_ss_angle_prime _Residue_analysis.Disulfide_chi2prime _Residue_analysis.Disulfide_chi1prime _Residue_analysis.Outlier_count_separate_geometry _Residue_analysis.Outlier_count _Residue_analysis.Entry_ID _Residue_analysis.Structure_validation_residue_list_ID . 001 ecloud orig full ' A' A ' 1' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.389 -5.2 1 O5'-C5'-C4' 102.893 -5.219 . . . . 24.24 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.405 -3.721 8 P-O3'-C3' 108.791 -9.091 . . . . 24.62 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.411 -3.201 4 P-O3'-C3' 111.517 -6.819 . . . . 26.54 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 4' ' ' ' DA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O5' 1.524 -6.865 4 P-O3'-C3' 128.596 7.413 . . . . 24.61 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 5' ' ' ' DT' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.397 -4.424 5 P-O3'-C3' 128.528 7.356 . . . . 22.45 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 6' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O5' 1.638 4.516 2 O3'-P-O5' 117.623 7.17 . . . . 21.72 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O5' 1.543 -4.957 2 P-O5'-C5' 105.138 -9.851 . . . . 21.49 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.396 -4.585 4 P-O5'-C5' 107.99 -8.069 . . . . 20.4 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 C3'--C2' 1.542 2.369 0 C4'-C3'-C2' 99.28 -3.92 . . . . 27.6 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.406 -3.634 4 OP1-P-OP2 109.593 -6.671 . . . . 29.24 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 11' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.677 5.858 6 O5'-C5'-C4' 97.621 -8.985 . . . . 22.05 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 12' ' ' ' DA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.413 -3.015 1 N19-C1'-C2' 107.707 -4.058 . . . . 15.68 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 13' ' ' ' DT' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.523 -7.003 4 P-O3'-C3' 129.319 8.016 . . . . 18.29 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 14' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.543 -5.293 3 OP1-P-OP2 104.783 -9.878 . . . . 20.14 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 15' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.552 -4.623 1 P-O3'-C3' 133.161 11.217 . . . . 18.87 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 16' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 P--O5' 1.524 -6.855 5 O4'-C1'-N19 115.27 9.338 . . . . 22.96 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 17' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 18' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 19' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 21' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 23' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' A' A ' 24' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 20' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 22' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud orig full ' B' B ' 25' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 1' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.389 -5.2 1 O5'-C5'-C4' 102.893 -5.219 . . . . 24.239999999999998 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.405 -3.721 8 P-O3'-C3' 108.791 -9.091 . . . . 24.620000000000001 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.411 -3.201 4 P-O3'-C3' 111.517 -6.819 . . . . 26.539999999999999 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 4' ' ' ' DA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O5' 1.524 -6.865 4 P-O3'-C3' 128.596 7.413 . . . . 24.609999999999999 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 5' ' ' ' DT' . . . . . 0.41 " H2'" ' C6 ' ' A' ' 6' ' ' ' DC' . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.397 -4.424 5 P-O3'-C3' 128.528 7.356 . . . . 22.449999999999999 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 6' ' ' ' DC' . . . . . 0.41 ' C6 ' " H2'" ' A' ' 5' ' ' ' DT' . . . . . . . . 1 P--O5' 1.638 4.516 2 O3'-P-O5' 117.623 7.17 . . . . 21.719999999999999 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O5' 1.543 -4.957 2 P-O5'-C5' 105.138 -9.851 . . . . 21.489999999999998 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.396 -4.585 4 P-O5'-C5' 107.99 -8.069 . . . . 20.399999999999999 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 C3'--C2' 1.542 2.369 0 C4'-C3'-C2' 99.28 -3.92 . . . . 27.600000000000001 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.406 -3.634 4 OP1-P-OP2 109.593 -6.671 . . . . 29.239999999999998 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 11' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.677 5.858 6 O5'-C5'-C4' 97.621 -8.985 . . . . 22.050000000000001 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 12' ' ' ' DA' . . . . . 0.543 " H2'" ' C6 ' ' B' ' 13' ' ' ' DT' . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.413 -3.015 1 N19-C1'-C2' 107.707 -4.058 . . . . 15.68 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 13' ' ' ' DT' . . . . . 0.543 ' C6 ' " H2'" ' B' ' 12' ' ' ' DA' . . . . . . . . 1 P--O3' 1.523 -7.003 4 P-O3'-C3' 129.319 8.016 . . . . 18.289999999999999 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 14' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.543 -5.293 3 OP1-P-OP2 104.783 -9.878 . . . . 20.140000000000001 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 15' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.552 -4.623 1 P-O3'-C3' 133.161 11.217 . . . . 18.870000000000001 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 16' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 P--O5' 1.524 -6.855 5 O4'-C1'-N19 115.27 9.338 . . . . 22.960000000000001 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 17' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 18' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 19' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 21' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 23' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' A' A ' 24' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 20' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 22' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud build full ' B' B ' 25' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 1' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.389 -5.2 1 O5'-C5'-C4' 102.893 -5.219 . . . . 24.24 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 2' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.405 -3.721 8 P-O3'-C3' 108.791 -9.091 . . . . 24.62 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 3' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.411 -3.201 4 P-O3'-C3' 111.517 -6.819 . . . . 26.54 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 4' ' ' ' DA' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O5' 1.524 -6.865 4 P-O3'-C3' 128.596 7.413 . . . . 24.61 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 5' ' ' ' DT' . . . . . 0.41 " H2'" ' C6 ' ' A' ' 6' ' ' ' DC' . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.397 -4.424 5 P-O3'-C3' 128.528 7.356 . . . . 22.45 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 6' ' ' ' DC' . . . . . 0.41 ' C6 ' " H2'" ' A' ' 5' ' ' ' DT' . . . . . . . . 1 P--O5' 1.638 4.516 2 O3'-P-O5' 117.623 7.17 . . . . 21.72 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 7' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O5' 1.543 -4.957 2 P-O5'-C5' 105.138 -9.851 . . . . 21.49 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 8' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 O4'--C4' 1.396 -4.585 4 P-O5'-C5' 107.99 -8.069 . . . . 20.4 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 9' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 C3'--C2' 1.542 2.369 0 C4'-C3'-C2' 99.28 -3.92 . . . . 27.6 . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 10' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.406 -3.634 4 OP1-P-OP2 109.593 -6.671 . . . . 29.24 . . . . . . . . . . 1 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 11' ' ' ' DG' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.677 5.858 6 O5'-C5'-C4' 97.621 -8.985 . . . . 22.05 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 12' ' ' ' DA' . . . . . 0.543 " H2'" ' C6 ' ' B' ' 13' ' ' ' DT' . . . . . . . . 0 O4'--C4' 1.413 -3.015 1 N19-C1'-C2' 107.707 -4.058 . . . . 15.68 . . . . . . . . . . 2 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 13' ' ' ' DT' . . . . . 0.543 ' C6 ' " H2'" ' B' ' 12' ' ' ' DA' . . . . . . . . 1 P--O3' 1.523 -7.003 4 P-O3'-C3' 129.319 8.016 . . . . 18.29 . . . . . . . . . . 3 2 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 14' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 P--O3' 1.543 -5.293 3 OP1-P-OP2 104.783 -9.878 . . . . 20.14 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 15' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 P--O3' 1.552 -4.623 1 P-O3'-C3' 133.161 11.217 . . . . 18.87 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 16' ' ' ' DC' . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 P--O5' 1.524 -6.855 5 O4'-C1'-N19 115.27 9.338 . . . . 22.96 . . . . . . . . . . 2 1 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 17' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 18' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 19' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 21' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 23' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' A' A ' 24' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 20' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 22' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 . 001 ecloud nobuild full ' B' B ' 25' ' ' HOH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0 0 . 1 stop_ save_